Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms