Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBFA2T2O43439 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms