Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3QR89 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QR89 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QR89 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QR89 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QR89 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QR89 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3QR89 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QR89 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QR89 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QR89 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QR89 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QR89 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QR89 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QR89 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QR89 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms