Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms