Protein–RNA interactions for Protein: A6NLW8

DUXA, Double homeobox protein A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAA6NLW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUXAA6NLW8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUXAA6NLW8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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