Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms