Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms