Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms