Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms