Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ID3Q02535 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ID3Q02535 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ID3Q02535 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ID3Q02535 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms