Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVK-16P61578 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms