Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms