Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms