Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms