Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP2Q9UHC6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms