Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms