Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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