Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms