Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms