Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms