Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SURF2Q15527 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms