Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms