Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms