Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms