Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms