Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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