Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRATO95237 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms