Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2J1Q9Y385 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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