Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RSG1Q9BU20 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms