Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms