Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBOF1Q8ND07 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms