Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HP1BP3Q5SSJ5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms