Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms