Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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