Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SIX1Q15475 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SIX1Q15475 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SIX1Q15475 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SIX1Q15475 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SIX1Q15475 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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