Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms