Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YBX2Q9Y2T7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms