Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFDQ9GZP0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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