Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RB1CC1Q8TDY2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms