Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms