Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms