Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GEN1Q17RS7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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