Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYT16Q17RD7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYT16Q17RD7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYT16Q17RD7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYT16Q17RD7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYT16Q17RD7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYT16Q17RD7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYT16Q17RD7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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