Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms