Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTK7Q13308 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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