Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms