Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1213.9 ms