Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNJ1P48048 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNJ1P48048 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms