Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms