Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms